二级生物安全柜是否可以使用明火，采用的是HEPA过滤器可以保人员，也可以保护环境样品，典型的程序，一般会用分身燃烧器，或者是其它明火进行消毒避免，降压感染，但是并不建议，在二级生物安全规程，使用这种明火，原因有以下几点：

首先，二级生物安全柜，传递的是乡下层流的气流，并且通过这种气流来保护样品，但是热空气上升，就会阻碍保护样品的能力。

第二，如果火焰熄灭了，共其乏雀保持打开，那么燃气体就不受限制的引入机柜栽安全柜中，70%的空气被再循环，可燃气体的浓度有可能会达到爆炸性的潜力，大大增加了实验室的风险。

第三，如果明火变得太热那么大，还具有融化粘合剂的能力，粘合剂是将过滤戒指保持在框上的，这就破坏了过滤器的有效性，导致怎样通风系统中的安全课损失。